5月12日和13日，农业部孙政才部长主持召开会议，紧急安排部署农业系统抗震救灾和抓好当前农业生产工作。会议决定，成立农业部抗震救灾指挥部，孙政才部长任指挥长，相关分管副部长任副指挥长，机关各有关司局主要负责同志任成员。

　　孙政才部长强调，农业系统要紧急动员起来，当前要重点做好六个方面的工作：
　　第一，要紧急行动，全身心投入到农业抗震救灾工作中去。要根据灾情发展情况，及时启动相应救灾应急响应，指导农业抗灾救灾工作。机关各司局、地方各级农业部门，特别是灾区农业部门要坚决贯彻落实党中央、国务院的部署，在当地党委、政府的坚强领导下，把做好农业抗震救灾、保证农产品市场供给作为当前压倒一切的大事。主要负责同志要靠前指挥，要做好灾区群众思想政治工作，维护灾区稳定。
　　第二，要摸清受灾情况，判断灾害走势，为救灾和恢复农业生产提供决策依据。灾区农业部门要加强灾情调度，切实做好灾情统计工作，努力做到数据准、情况明。要组织农业技术人员，深入灾区农业生产第一线，实地了解受灾情况，科学评估损失程度，在掌握第一手情况的同时，认真研究和现场指导农业救灾和恢复生产工作。对可能发生的次生灾害，要认真分析，科学应对。要加强应急值守，实行24小时值班，随时了解情况，做好信息汇总和上报工作。要加强新闻宣传，正确引导舆论。
　　第三，要加强疫情监测，切实做好重大动植物疫病防控工作。要强化环境消毒、强化疫情监控、强化无害化处理、强化灾后免疫，强化检疫监管，防止病死畜禽流入市场，确保大灾之后无大疫。要积极推动灾区农村开展爱国卫生运动，保持环境卫生。要组织好消毒药品和疫苗的调运工作，保证灾区需要。要把此项工作放在农业救灾的突出位置。
　　第四，要树立全国一盘棋思想，确保灾区市场供应。要加强粮食和鲜活农产品调运，继续执行好农产品绿色通道政策，保证灾区市场供应。非灾区要发挥“一方有难、八方支援”的优良传统，立足当前抗震救灾大局，切实抓好农业生产，积极支持灾区农业抗灾救灾工作。要动员社会力量参与救灾工作。
　　第五，要着手制定重建方案，及早筹划灾后恢复农业生产工作。农业部和灾区各级农业部门要立足当前，着眼长远，科学谋划，统筹安排灾后重建工作。要科学分析农业灾情，合理评估农田设施、畜禽圈舍、养殖塘坝等基础设施坍塌损毁情况，选择适宜的抗灾救灾技术路线，拟定符合当地实际的生产资料等各项物资保障预案，制定具有长远眼光的基础设施灾后重建方案。加强与有关部门的协调沟通，争取多方支持，全力做好资金、技术、物资、施工等各项准备，尽早启动灾后重建和恢复生产工作，力争抗灾夺丰收。
　　第六，要统筹兼顾，全力抓好当前农业生产工作。一手抓抗震救灾，一手抓当前生产。要精心组织、周密安排，加强夏季粮油作物田间管理，组织好小麦跨区机收，确保颗粒归仓，保证夏粮获得好收成。