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事发地：南京玄武湖
1986年，南京玄武湖首次暴发蓝藻，4月，玄武湖出现了“黑水”，湖水发臭；5月，全湖发现大面积死鱼，有时一天能打捞起万斤以上的死鱼。2005年7月，玄武湖再次暴发蓝藻，从8月6日开始，每天能清理出蓝藻200卡车，至9月18日，玄武湖3平方公里的湖面就像铺了一层厚厚的绿地毯，严重的地方因蓝藻腐烂还发出阵阵恶臭。
事发地：云南滇池
滇池自上世纪90年代开始，蓝藻水华暴发的次数越来越多，面积越来越大，1999年达到最高峰，水华覆盖面积达到20平方公里，厚度达到几十厘米。
科技部2000年4月投入5000万元经费，启动了“滇池水污染治理技术研究”。
事发地：安徽巢湖
安徽省巢湖自上世纪70年代以来，蓝藻频发。2003年8月，巢湖东半湖
炀至巢湖闸段蓝藻暴发，遍及湖心，最厚的地方深度达1米以上，有浪无波，几乎形成“冻湖”。2006年6月，巢湖水域再次出现大面积蓝藻，使湖水呈翠绿色、粘稠状。
事发地：澳大利亚达令河系
1991年，澳大利亚达令河系发生世界上有记录以来最大规模的蓝绿藻水体，绵延1000公里以上，花费了上亿美元的治理，仍收效甚微。
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