环保部近期下发《关于2011年环境保护部挂牌督办环境违法案件的通知》，在本次被环保部点名挂牌督办的15家企业中，有10家是制药相关企业，其中包括了2家上市公司：永安药业和海正药业。
　　上海证券点评称：
　　所谓挂牌督办，就是对环境违法企业进行警示和提醒。被挂牌督办的企业，期间的生产经营可以照常进行，但是需要在最后期限内完成整改。环保部有关人士表示，环保部每年会推出专项检查，检查企业环境违法行为，其中制药行业一直是重点检查领域。
　　制药行业是国家进行化学耗氧量、氨氮排放监管的重点行业之一。环保部公开数据显示，2009年中国制药工业总产值占全国GDP不到3%，而污染排放总量却占到了6%。在制药业中，原料药行业属高污染、高耗能产业，对大气、水域的污染尤为严重。曾有媒体报道，浙江八成原料药生产企业的环保措施不达标。
　　从行业本身来看，原料药生产需要消耗大量的粮食及化工原料，容易造成“高污染、高耗能”。尤其是原料药生产要消耗大量粮食、水、电等资源，其中生成的原料药成品只占小部分，大部分变成了废水、废气和废渣，并且排出的“三废”中往往污染物浓度高、成分复杂，处理难度大。
　　同时，生产一种原料药往往需要进行少则几个多则数十个步骤，使用的原材料有的甚至多达三四十种，不仅产生的废水、废渣数量大，而且含有大量难以生化降解的化学合成物质和残留药物成分，因此原料药生产企业的废水处理难度要远远高于普通的大化工厂，这也是原料药生产企业共同面临的行业难题。有专家指出，整个原料药生产行业，真正环保达标的企业不超过20%。
　　此外，国内大部分原料药生产企业从事的是最低端的生产，是典型的低附加值高污染，一些规模较小的企业利润原本就十分微薄，因此在环保投入上也显得力不从心。例如，维生素或抗生素行业，同品种生产企业数量多，产能过剩严重，导致污染治理费用在产品制造成本中占有较高的比重。从国际趋势看，因为在一些发达国家处理“三废”的成本往往要超过药品生产本身，所以发达国家多年前就把高污染、低附加值的原料药产业转移到发展中国家。
　　2010年7月开始实施的《制药工业水污染物排放标准》为国家首次发布制药工业污水排放标准，是国家强制性标准，主要指标均严于美国标准。考虑到节能环保是“十二五”规划的战略性新兴产业，未来几年国家将会进一步加大环保措施的实施和对环境监管的力度。很多原料药企业现有的废物污染防治设施能力与该标准要求存在着差距，企业必须采取措施应对。预计环保费用将大幅度上升，那些以牺牲环境为代价的重污染生产工艺以及相应的中小企业将被加速淘汰。
　　短期看，国家加大环保监管力度，无疑会增加企业的环保成本，造成企业利润下滑；但长期看，加大监管对原料药行业的发展利大于弊。首先，上市公司都属于各行业的龙头企业，一些中小企业停产，可以扩大其产品的市场占有率；第二，有利于促进企业进行上下游整合，提高产业链覆盖率；第三，有利于促使企业在新药研发上加大投入比例，提升产品竞争力。
　　国泰君安证券发布的报告表示：医药估值探底是政策预期和资金调仓双重作用的结果。A股的“去故事化”进程将让市场更加坚守价值股，处于成长中的中国医药股应享受估值溢价，政策风暴后将诞生更完美的中国制药巨头。这注定是一场艰苦的战争，会有不断反复和纠缠，最为黑暗的时刻也许就是机会最大的时刻。我们始终相信，史上真正牛股的逻辑只有一个，就是业绩持续不断超预期高速成长。我们建议在2012年持续关注具有创新能力和国际化视野的恒瑞医药、莱美药业；在中药领域关注具有独特资源和实力的东阿阿胶、云南白药、康美药业；在医疗器械领域关注宏达高科、鱼跃医疗；在医院产业关注爱尔眼科、开元投资。