瞭望智库与财国周刊在调研中获悉，自贸区的金融改革开放力度巨大，将完全实行利率市场化。银行在自贸区设立分支机构将不受“同城只能设立一家分行”的规定限制，可以直接设立“分行”而不是“支行”。
　　浦发银行内部人士对瞭望智库与财国周刊表示，银行在自贸区设分支机构将享受优惠政策。在上海已有一家分行的中外资商业银行，在自贸区里设分行将不视为同城分行。目前，浦发银行在自贸区内已有外高桥、南汇、临港三家支行。总行方面也在力推此事，未来将在资源、人力上向自贸区分行倾斜。具体操作上，银行在自贸区内设分行，须先由上海银监局初审，然后由银监会审核批准。目前，除浦发银行外，中国银行正申请进驻自贸区。此外，渣打、汇丰、东亚等外资银行据信将成为首批获准在自贸区开办业务的银行。
　　瞭望智库与财国周刊了解到，自贸区内商业银行原先设有的支行，可以就地翻牌。不过，接近方案设计的人士透露，希望进驻自贸区的新银行或企业尚在申请筹备阶段，在正式挂牌前应不会进入，因为很多机制还没运作起来，比如企业进去怎么注册，向谁来注册，机构怎么运作……这些操作层面的问题没有解决。所以，自贸区在挂牌后较短的时间内会有一个空窗期与调整期。
　　另外，自贸区所涵盖的四个功能区，即外高桥保税区、外高桥保税物流园区、洋山保税港区和上海浦东机场综合保税区，原本在功能上各有不同。目前四个功能区如何定位还在协调。瞭望智库与财国周刊认为，洋山港比较适合开展贸易便利化试点，浦东机场由于客流密集，是试行人民币资本项下可兑换、人民币国际化以及购物的最佳场所。而能够承载金融类企业进驻的区域则很可能是外高桥保税区。不过，外高桥保税区已没有太多土地空间。
　　瞭望智库与财国周刊获悉，自贸区将实现利率市场化，存贷款利率都将取消管制；但在人民币自由兑换方面，对于是全面放开，还是仅仅“资本帐户项下”放开，现在还存在分歧。此外，自贸区内企业将可以自由向中外资银行进行融资借贷，外资银行将享受国民待遇。