4月10日晚，长航凤凰发布公告称，由于航运市场持续低迷，公司严重亏损，资金极度紧张，致使公司已到期的贷款本金和利息未能如期偿付。截至2013年4月9日，公司（包括公司控股子公司长江交科）共有逾期的贷款本息合计44,760万元，占公司最近一期经审计净资产的比例为342.73%，占公司最近一期经审计总资产的比例为5.07%。
　　涉及本次逾期贷款的银行和金融机构则包括工银租赁、交通银行、招商银行、兴业银行、光大银行、进出口银行、浦发银行7家。其中涉及交通银行的逾期贷款近3亿元。
　　长航凤凰表示，以上贷款逾期平均时间为21天，公司不排除相关银行通过法院申请财产保全等手段对公司的资产进行冻结、查封或扣押的可能性，公司将积极与有关各方协商，寻求妥善解决问题的办法。
　　而为了缓解资金压力，此前长航凤凰已经抵押逾10艘船舶向多家银行申请贷款。
　　长航凤凰3月13日公告称，公司拟向浦发银行、民生银行、中信银行等6家银行合计申请约6.21亿元的固定资产贷款或流动资金贷款。其中向招商银行约申请贷款1.06亿元，抵押物为"瑞江5号"等6艘长江自航船和"长航江洋"等3艘海轮。而除了向浦发银行申请的5135万元固定资产贷款为十年期外，其余贷款期限均为一年。
　　同时，因公司在2010-2011年向交通银行贷款1930万美元，为维持银行原项目贷款授信，长航凤凰将两艘船舶长迅3号、满江海抵押给交通银行。
　　此外，为了缓解资金支付压力，长航凤凰与交银金融租赁有限责任公司协商，决定将2013年到2014年应按季度支付的租金8128万元调整到2014年底支付，在此期间，融资本金仍按原利率计息。预计2013-2020年间每年将新增租金成本173万元。
　　而为减少亏损，公司还决定将目前的以长江干散货运输业务为主的航运综合经营方式转变为船舶租赁经营。
　　长航凤凰此前发布的业绩预告显示，2012年公司净利润亏损8亿元至9亿元，主要是由于国际干散货市场指数BDI在低位徘徊，平均916点，较去年同期平均1,548.69点减少632.69点，减幅40.85%，公司远洋业务受此影响较大。以及国内江、海运输需求不旺，运价下跌，同时燃油及相关成本居高不下，导致公司收入利润率下降。此外，公司在报告期内还新增的辞退福利费用约7000万元。