日本农林水产省26日宣布，在爱知县丰桥市养鸡场出现的大量死鸡，在禽流感测试中呈现阳性反应。如果进一步的详细检测确认其感染的是高致病性禽流感，出现疫情农场内的15万只鸡将被宰杀。这已经是本月继宫崎县、鹿儿岛县之后，日本又一农业大县出现禽流感疫情。
1月23日，日本宫崎县新富町一家养鸡厂发现20只鸡死亡，其中6只在禽流感检测中呈阳性反应，经过进一步详细检查确认，其中5只感染了高致病性禽流感病毒。
宫崎县政府已开始对该养鸡场内全部约41万只鸡进行屠宰处理，并禁止养鸡场周围半径10公里内的鸡和鸡蛋运出。加上因上一次疫情而采取的限制措施，该县目前被禁止运出的鸡合计达400万只。
随后的26日凌晨，鹿儿岛县出水市一家养鸡场的死鸡确认感染H5型禽流感病毒，该养鸡场饲养的8600只鸡已宰杀完毕，有关部门设定以该养鸡场为中心的半径10公里内为移动限制区域，区域内的522万只鸡成为限制对象。
综合日本媒体报道，在宫崎县发现的禽流感病毒被确认为强毒性的H5N1型，病毒样本与去年11月岛根县安来市的病鸡以及富山县疣鼻天鹅身上取得的DNA排序相同之处超过了99%，
京都产业大学禽流感研究中心主任大槻公一认为，去年10月中旬北海道从野鸭粪中最先检测到H5型病毒。此后，富山、鸟取县的白天鹅及岛根县的家禽等相继被感染。由此可推测出此次疫情是由从西伯利亚南飞的候鸟携带的病毒所致。
目前，日本环境省已加强了对宫崎县野鸟尸体、粪便的监控。
鹿儿岛县是日本养鸡第一大县，2009年其肉鸡销售额居全国首位。爱知县蛋鸡出货量位居全国第三，该县221家养鸡场都聚集在出现病情的养鸡场周围。据官方统计，仅2009年，宫崎县家禽产出额就高达76200万美元。疫情恐将对当地的农业带来重大影响。
1月26日上午，日本政府“禽流感对策阁僚会议”在首相官邸召开，首相菅直人表示必须要防止感染扩散。
陆上自卫队当天从都城驻地（位于该县都城市）向该农场派出约170名队员，27日起开展已扑杀鸡禽的掩埋工作，成了“杀鸡队”。