我国要发展自主知识产权的航空生物燃料，可选择的生物燃料种类很多，业内人士认为，就我国国情而言，以藻类生物燃料为突破口是最好的选择。目前我国在藻类生物燃料的研发方面已取得一定的进展，但要在这方面取得进一步突破、并尽快用作航空燃料，还需跨越多个障碍。
已初具规模制备生物燃料的条件
藻类具有的特点非常适合我国的国情，而且从全球藻类生物燃料的研发来看，我国起步也并不晚。到目前为止，我国已拥有了一批掌握藻类生物燃料实验室技术的一流专家，并在部分企业开展了藻类生物燃料的中试培养和规模化示范。
藻类生物燃料的核心技术主要涉及藻类的筛选和基因工程改造、养殖、光生物反应、收集及油脂提取等，其中藻类基因工程改造和养殖是当前制约藻类生物燃料生产低成本化的关键技术。我国在藻类生物燃料方面的研究从上世纪80年代就已起步，目前与西方的差距很小。
如清华大学藻类能源实验室早在1988年就开始关于藻类生物燃料的研究，目前拥有国际领先的科研实力。中国水产科学研究院、中科院海洋研究所等单位也正在开展以海洋藻类为原料生产生物柴油的研究。上海交通大学藻类制油研究课题组计划开发适合工业化生产的连续采收、能源消耗低的脱水干燥和微藻制油技术，建立规模化的微藻制油工厂，在大型容器中养殖微藻。
在藻类生物燃料产业化方面，我国也已经开始进行了藻类生物燃料的中试培养和产业化示范，这标志着我国初步具备了规模制备生物燃料的条件。
2008年，致力于新能源开发的民营企业新奥集团在国内率先建成1000平方米的中试规模藻类养殖基地及油脂提取制备车间。2010年，新奥集团、中石化、海南的洋浦绿地能源科技有限公司(外资企业)和包头的金骄集团等也开始启动或预备启动藻类生物能源项目。其中，新奥集团在内蒙古达拉特旗启动的藻类生物能源产业化示范工程，在沙荒地上利用煤化工的二氧化碳规模化养殖能源藻类，并利用工业余热降低养殖成本。该项目计划在2-3年内完成产业化示范。
尚缺乏权威性的技术路线规划
我国在藻类生物燃料的研发方面目前已取得一定的进展，但业内人士认为，要在这方面取得进一步突破、并尽快用作航空燃料，还需跨越多个障碍。
第一，我国藻类生物燃料研究尚未形成合力。《经济参考报》记者调查发现，尽管我国不少科研团队在藻类各项技术研发上都取得了进展，但目前他们在研究方向和方法上存在较大的分歧，对彼此的研发进展也不甚了解。不少科研机构“墙内开花墙外香”，在国际上已具有较高的知名度，但国内各界对其研发成果仍了解有限。
第二，缺乏权威性的技术路线规划。这也是导致我国科研机构各自为战、研究方向不一致的原因之一。美国由能源部牵头，目前已发布两版微藻生物燃料技术路线图，从藻类资源到各项关键技术的梳理，为美国相关领域的研发提供了重要的指导作用。
第三，跨学科的研发团队力量不足。高成本是目前藻类生物燃料技术产业化的最大瓶颈，而突破这一瓶颈需要通过多学科交叉、集成创新手段来实现，这不仅涉及生物工程等藻类基础研究学科，还涉及材料学、环境学等多个领域，需要多学科的研究团队才能完成这项艰巨任务。目前我国这样的多学科团队力量还不多。
第四，研发资金投入有待进一步加大。以美国为例，藻类生物燃料的研发资金既包括政府拨款，也包括财团、企业的资助，投资规模以十亿美元计。尤其是政府在财政预算中明确拨款，不仅能补充科研资金不足，还能起到较好的资金导向作用。另外，充分调动民间力量融资，也能更好地达到产学研的沟通。
应鼓励民间资本流向该技术研发
中国石油大学新能源研究中心傅鹏程教授、中科院青岛生物能源与过程研究所刘天中博士等多位专家建议，国家应尽快采取有力措施来推动我国藻类生物燃料的发展和应用。
一是应从国家战略层面来规划藻类生物燃料研发。藻类生物燃料的开发，具有重要的政治、经济和科学意义，还涉及国家经济和环境安全，应将其纳入战略性新兴产业，提高到国家战略的高度。目前，我国战略性新兴产业中与藻类生物燃料相关的包括新能源、生物育种，但二者的涵盖面都较广。应明确藻类生物燃料作为战略性新兴产业的地位，并出台全国性的产业远景规划以及产业技术路线图等，以更好地引导技术研发和产业化项目的开展。
二是要整合国内相关研发资源，加紧技术攻关。目前我国已拥有多位藻类生物燃料研究的一流专家，若将其研发成果共享，并使其形成合力，必能大大推进我藻类生物燃料技术的研发。不仅要依托国内现有的藻类生物燃料科研力量，建立一支藻类能源科技领域的“国家队”，还应通过优惠政策，吸引在美国、以色列、日本等国从事相关领域研究的中国专家及早“归队”，增强我国藻类生物燃料的科研实力和后备力量，尽快实现在关键技术上的新突破。
三是加大政府投入，鼓励大企业参与研发。国家应加大对藻类生物燃料的科技支持力度，从政策和资金两条途径推动技术研发。一方面，政府有必要向直接相关的项目进行投资，从而起到激发研发积极性并引导其他企业参与的作用；另一方面，也要通过相关政策倾斜，鼓励民间资本流向该领域的技术研发。
四是有序构建藻类生物燃料产业体系。在技术突破的基础上，着眼未来生物能源产业，建立高素质的藻类能源产业体系。该体系应突出产学研结合，突出技术集成，大力推动新型海洋生物能源产业的形成和发展；也应突出生物能源的综合利用，使可从藻类中得到的生物柴油、乙醇、甲烷等得到充分利用和发展；还应考虑联接工业和农业，充分利用农村劳动力。
五是增加政府补贴，规划好藻类生物燃料销售网络。当前，藻类生物燃料在商业化方面还不具有成本竞争力，还需通过政府在价格调控、税收优惠、市场配额、资金补助、市场准入等方面制定进一步指导政策，扶持藻生物燃料产业的健康发展。
六是国家要尽快组织国内企业把藻类生物燃料应用于航空业。现在波音、空客等国外公司已在用生物燃料替代传统航空燃料进行航空试飞，对此国家应尽快引导国内航空企业与国内能源企业、能源研发机构结合起来，把藻类生物燃料尽快应用于航空业，以便在今后航空碳减排方面占据主动地位维护国家利益。